ארכיון יד טבנקין אוצר בחובו את הארכיון ההיסטורי של "הקיבוץ המאוחד", חלק מארכיונה ההיסטורי של "התנועה הקיבוצית המאוחדת (תק"ם)", ואת הארכיון החי של "התנועה הקיבוצית". כמו כן את הארכיונים של תנועות נוער רבות בארץ ובחו"ל (כמו "המחנות העולים", "הנוער העובד והלומד", "תנועת הצופים", "הבונים דרור", "החלוץ למרחב" ועוד), ארכיונים של תנועות פוליטיות שהיו קשורות עם הקיבוץ המאוחד, בארכיון נמצאים גם ארכיוניהם של אישי ציבור רבים, אוספים של עלוני הקיבוצים, כרזות, תצלומים, קלטות אודיו ווידאו, דגלים ומוצגים.

כמו כן מצוי בארכיון מדור תיעוד בעל פה הכולל ראיונות אישיים רבים. אוספים נוספים הראויים לציון הינם אוסף הגדות הפסח מהקיבוצים ואוסף חומרים הקשורים לכוח המגן העברי.